Bij twijfel over de doodsoorzaak neemt de arts contact op met de forensisch arts en zal een autopsie wellicht geregeld worden. Autopsie houdt in ontleding van het stoffelijk overschot door een patholoog-anatoom, visueel en microscopisch onderzoek van organen, alsmede biochemisch onderzoek van lichaamsvochten, maaginhoud enz. Een autopsie zal de aanwezigheid van medicijnen (en alcohol) in het lichaam aan het licht brengen. Als het medicijn ongebruikelijk is, of moeilijk te verkrijgen, zullen zeker vragen gesteld worden of er wel of geen hulp is geboden bij het verkrijgen, voorbereiden en innemen van de stof.
Tot autopsie wordt in het algemeen alleen overgegaan als sprake is van een juridisch of medisch raadsel rond het overlijden. Dat wil zeggen als onzeker is hoe of waarom betrokkene is overleden. In deze gevallen, vooral als de mogelijkheid bestaat dat op enigerlei wijze hulp bij de zelfdoding is geboden, zal de beslissing worden genomen ongeacht wensen van de familie. Bij overduidelijke gevallen van zelfdoding zijn autopsies over het algemeen niet gebruikelijk. Autopsies zijn duur en worden alleen uitgevoerd als het een duidelijk nut heeft. Ze zijn echter ook mogelijk vanuit politieke motieven, maar dat komt zelden voor.
Stoffelijk overschot met etiketten gereed voor autopsie