Datos: Instrumentación Diseño del Laboratorio Inteligente 2015 En los años 80, los directores técnicos de los


laboratorios clínicos reconocieron que el único modo de alcanzar los objetivos económicos era sacando el máximo partido de la automatización e impulsando la integración de los sistemas. El programa recibió el título de “Automatización total del laboratorio” y derivó en una serie de estándares que permitieron la conexión de los sistemas de datos de instrumentos con los Sistemas de Información de Laboratorio (equivalentes al LIMS) y los sistemas administrativos hospitalarios. Dichos estándares fueron recopilados


por Health Level Seven International HL7 (www.hl7.org), entidades que proporciona el formateo de mensajes y de datos. Aunque los sistemas hospitalarios y clínicos poseen la ventaja de que la variedad de tipos de análisis y de muestras sea limitada, hecho que facilita la estandarización, no hay nada de su estructura que impida su aplicación a una gama más amplia de instrumentos, como por ejemplo la espectrometría de masas. Un examen de la estructura del HL7 revela


que sería una base sólida para resolver los problemas de integración de la mayoría de laboratorios. Desde el punto de vista de la transferencia


de datos y las comunicaciones, las necesidades de los laboratorios clínicos son similares a las de otros campos. Los principales cambios afectarían a los elementos que son específicos de los requisitos de cada hospital y de cada paciente, como los diccionarios de datos y las descripciones de campo. Una solución para los distintos sectores industriales beneficiaría a los proveedores, puesto que simplificaría su diseño y soporte, quienes suministrarían un producto con un interés comercial más amplio y animaría a implementarlo como solución. La mayoría de los primeros trabajos de


estandarización hechos fuera del ámbito clínico se ha centrado en la encapsulación de los datos, aunque recientemente se han incluido protocolos de comunicaciones: • En los años 90, el empeño de los proveedores de instrumentos condujo al desarrollo de los estándares ANDI (Analytical Data Interchange, intercambio de datos analíticos) que desembocó en la ASTM E1947 – 98(2009) Standard Specification for Analytical Data Interchange Protocol for Chromatographic Data (Especificación estándar para un protocolo de intercambio de datos analíticos cromatográficos), que recurre a la estructura de base de datos de dominio público netCDF, lo cual posibilita la independencia de plataforma. Este estándar es soportado por diversos productos de proveedores, pero no goza de un uso generalizado


• SiLA Rapid Integration (www.sila- standard.org). La página web afirma: “El consorcio SiLA para la estandarización de la automatización del laboratorio desarrolla


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y difunde nuevos estándares de gestión de datos y de interconexión con el fin de facilitar la integración rápida de los sistemas de automatización del laboratorio. SiLA es una corporación sin ánimo de lucro con presencia mundial que está abierta a instituciones, empresas y personas del sector de la automatización del laboratorio de ciencias de la vida. Muchos fabricantes importantes de sistemas, proveedores de soſtware, integradores de sistemas y corporaciones farmacéuticas y biotecnológicas son miembros del consorcio SiLA y contribuyen en diferentes grupos técnicos de trabajo con sus expertos altamente cualificados”


• La Pistoia Alliance (www.pistoiaalliance.org) declara: “La Pistoia Alliance es una alianza global precompetitiva, sin ánimo de lucro que está integrada por empresas, proveedores, editores y grupos académicos de ciencias de la vida y que pretende derribar barreras a la


“ En los años 80, los directores técnicos de los laboratorios clínicos reconocieron que el único modo de alcanzar los objetivos económicos era sacando el máximo partido de la automatización e impulsando la integración de los sistemas”


innovación,mejorando la interoperabilidad de los procesos comerciales de I+D. Nos diferenciamos de los grupos convencionales porque reunimos los componentes clave para descubrir las causas últimas de las ineficiencias en I+D y desarrollar buenas prácticas y proyectos piloto tecnológicos para superar los obstáculos habituales”


• La Allotrope Foundation (www.allotrope.org): “La Allotrope Foundation es una asociación internacional de empresas farmacéuticas y biotecnológicas que construyen un marco común de información de laboratorio para dotarse de medios interoperables destinados a generar, almacenar, restituir, transmitir, analizar y archivar datos de laboratorio y objetos comerciales de alto nivel tales como informes de estudios y expedientes normativos”


• El lenguaje de marcación AnIML para datos analíticos (animl.sourceforge.net) está desarrollando una especificación estándar bajo la ASTM (www.astm.org/DATABASE. CART/WORKITEMS/WK23265.htm) concebida para ser ampliamente aplicable a los datos de instrumentos. Se prevé que los primeros resultados sean aplicables a los campos de la cromatografía y la espectroscopia.


Es de notar que los puntos dos, tres y cuatro


son básicamente orientados a los sectores de la industria farmacéutica y biotecnológica. Si bien los proveedores querrán ese mercado, su escasa amplitud podría frenar la adopción puesto que podría conducir al desarrollo de estándares para diferentes industrias, con el consiguiente incremento de los costes de implementación y de soporte. Los problemas comunes en diferentes sectores y aplicaciones conducen a soluciones comunes. Y los proveedores no ignoran el problema


de la integración de los instrumentos con la informática. Sus paquetes de productos ofrecen funciones de conexión para diversos tipos de instrumentos con el fin de facilitar el trabajo. La planificación de las necesidades de gestión de la información del laboratorio debe comenzar por el punto más crítico, el LIMS por ejemplo, y pasar al modo en que el producto soporta el instrumento. Será más sencillo trabajar con productos que respondan a la capacidad del LIMS que modificar el sistema para soportar algo nuevo.


Resumen del capítulo


La transición del procesamiento manual de las muestras y de los experimentos al empleo de sistemas electrónicos para registrar los datos es un paso crítico. Supone pasar de trabajar con objetos reales a hacerlo con su representación digital en formato binario. Todos lo demás elementos del laboratorio inteligente dependen de la integridad y la fiabilidad de esa transformación. Tal vez los planificadores de los sistemas de laboratorio no tengan que programar nunca un sistema de adquisición de datos, pero tienen que entender cómo funciona y el papel que en su uso desempeña el profesional de laboratorio cualificado. Esa labor preliminar permitirá a los planificadores aprovechar plenamente los productos comerciales. Una de las claves para mejorar la


productividad del laboratorio estriba en diseñar un proceso automatizado para la preparación de las muestras que introduzca la muestra en el aparato, haga las medidas y transmita los datos a los sistemas de almacenamiento, gestión y uso. Conocer los elementos y las opciones de dichos sistemas constituye la base para el diseño de sistemas que satisfagan las necesidades del laboratorio actual y futuro. El desarrollo del laboratorio inteligente se


halla en un punto de inflexión. Como los usuarios comienzan a saber lo que es posible hacer, su conformidad con la situación actual disminuirá a medida que reconozcan el potencial de sistemas mejor diseñados e integrados. Comprobarán que el potencial depende de los mismos elementos que han dado resultado en los sectores de la fabricación, la infografía, la electrónica y otros: una arquitectura subyacente para la integración, basada en estándares para la encapsulación/ intercambio de datos y las comunicaciones. n


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